生命科學|當“核酸”遇上“質譜”——多重分子診斷技術的下一站
發布時間:2022-07-04
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新冠病毒肺炎疫情的爆發,推動了國內分子診斷技術的高速發展,同時也使得“核酸”成為大家耳熟能詳的詞匯。當前的核酸分析技術,主要是基于熒光定量PCR(qPCR)的原理,雖然具有靈敏、準確、便捷的優勢,但卻通常只能對少于5個的靶標進行分析。不過這樣相對有限的檢測靶標數目,雖然在新冠檢測等特定應用場景已經足夠有效(即判斷是否感染新冠),卻難以應對一些復雜疾病的檢測,如腫瘤、出生遺傳缺陷、精準用藥的檢測等。因為這些疾病通常都涉及到更多的基因變異情況,需要有具備更廣泛的檢測能力的技術。而核酸質譜技術,就是一個非常好的進行多重核酸分析的分子診斷平臺。
說到質譜的技術,領域內的人應該并不是完全陌生。顧名思義,質譜就是對“質量”進行精確檢測的精密設備,也是臨床診斷領域快速發展的未來平臺之一。質譜可以用來檢測蛋白質和代謝物,也可以用來檢測核酸。生命的遺傳物質DNA分子是由4種堿基——ATCG所構成的,每種堿基的分子質量不同。核酸質譜猶如一把高精度的天平,可區分單個堿基的質量差異(G>A>T>C)(圖1)。當核酸發生變異的時候,不論是堿基的替換還是修飾,都會改變DNA的分子質量,核酸質譜通過對這種質量變化的精確分析,就能夠對其進行精準的識別。通過這種方式,核酸質譜既可以檢測基因的多態性和基因的突變,也可以檢測核酸的化學修飾,還能夠對拷貝數變異和修飾水平等進行定量的分析。
相比傳統的qPCR等分子診斷手段,核酸質譜擁有多重、準確、高通量的優勢。這是由核酸質譜的檢測原理和技術路線所決定的。首先,核酸質譜直接依據分子量的差異來進行檢測,只要待測靶標擴增后的分子量不同,就可以相互區別開來,不會像傳統的qPCR一樣受到熒光通道數的限制。因此,核酸質譜通常能夠實現30-50重乃至更多靶標的分析,而傳統的qPCR方法單次檢測通常小于5重。其次,由于采用了兩步擴增反應,再加上對質量直接進行檢測,因此核酸質譜具有極強的準確性和特異性,抗干擾能力強,適合于復雜背景下的低豐度靶標分析。最后,核酸質譜檢測速度極快,每個樣本在質譜檢測環節僅需數秒的時間,適合于大批量的樣本的分析(圖2)
核酸質譜的優勢決定了它特別適合于復雜的、多靶標疾病的分子診斷。主要包括出生遺傳缺陷、腫瘤、藥物基因組、病原體多聯檢和耐藥檢測等。詳見如下表:
得益于本身的優良性能和廣闊的應用前景,核酸質譜受到了行業內越來越多的關注,可謂是分子診斷的“明日之星”。然而當前,國內的核酸質譜仍主要被進口品牌及其OEM廠商所壟斷。由于其技術難度較大、產品功能復雜,國內能夠布局該平臺并掌握核心技術的廠家仍是寥寥。在這種情勢下,聚光科技集團下屬的聚致生物,已經完成開發了原生的、具有獨立自主知識產權的核酸質譜系統,并同國內一些知名的分子診斷試劑研發企業進行合作,開拓這一極富前景的新領域,為健康事業做出新的貢獻。